Уредбом о допуни Уредбе о оснивању Канцеларије за европске интеграције из јуна 2010. године (Службени гласник РС, број 42/10), надлежност Канцеларије је проширена на учешће у усклађивању активности у области планирања и коришћења европских фондова, донација и других облика развојне помоћи из иностранства.

На основу поменуте Уредбе, у Канцеларији је формиран Сектор за планирање, програмирање, праћење и извештавање о средствима ЕУ и развојној помоћи и Сектор за прекограничну и транснационалну сарадњу, који обављају послове које је до тада обављао Сектор за ЕУ фондове и развојну помоћ Министарства финансија.

У Сектору за планирање, програмирање, праћење и извештавање о средствима ЕУ и развојној помоћи обављају се послови који се односе на: припрему стратешких докумената којим се дефинишу национални развојни циљеви и приоритети за коришћење средстава Европске уније и развојне помоћи; координацију са надлежним органима и организацијама државне управе, локалне самоуправе и осталим релевантним институцијама ради утврђивања ресорних, међуресорних и регионалних стратегија, приоритетних потреба и избора одговарајућих пројеката и програма које треба финансирати из средстава Европске уније и развојне помоћи; обавештавање донатора о приоритетним пројектима и програмима; сарадњу са донаторима на усклађивању приоритета донатора са приоритетима Републике Србије; учествовање у припреми донаторских стратегија и планирању програма и пројеката који се финансирају из средстава ЕУ и развојне помоћи; праћење реализације пројеката и програма кроз извештаје корисника средстава ЕУ и развојне помоћи и донатора, као и координацију у обезбеђивању евалуационих извештаја; усклађивање програма и пројеката са приоритетима Републике Србије, и у складу с тим, остваривање сарадње са надлежним органима и организацијама државне управе, асоцијацијама градова, привреде и другим институцијама; развој и унапређење ИСДАКОН ИС у вези са средствима ЕУ и развојном помоћи; прикупљање података, аналитичку обраду података и припрему извештаја о фондовима ЕУ и развојној помоћи; извештавање надлежних органа, Владе и међународних институција о реализацији пројеката финансираних из средстава ЕУ и развојне помоћи, као и друге послове из ове области. У Сектору има 17 систематизованих радних места.